El 24 de junio de 1988, Juan Pablo II nombró el quinto Obispo de la Diócesis a Monseñor Jorge Ardila Serrano (1988-2001), tomó posesión el 23 de julio de 1988. creó 13 parroquias en la Diócesis. Su gran atención y preocupación por la vocaciones sacerdotales; fundó y organizó el seminario Mayor de la Inmaculada Concepción de Girardot en 1994. Durante su período se ordenaron 65 sacerdotes para la Diócesis. Además conformó en 1998 un equipo de sacerdotes de tiempo completo, denominado Equipo Diocesano de Animación Pastoral (EDAP): se trata de un organismo central de colaboración diocesana para la Pastoral. Durante este período, se ha realizado dos Misiones: con la colaboración de todos los sacerdotes y de seglares preparados, para catequesis, celebraciones, asambleas familiares y otras actividades pastorales. En 1989 se adelantó la “Misión Mariana”.

Entre 1991-93, con la colaboración de sacerdotes, religiosos y seglares aun de otras jurisdicciones, se llevó a cabo la “Misión de Reconciliación”, con programas y material preparados por la Conferencia Episcopal. Con motivo de gran Jubileo del año 2000, se llevó a cabo por toda la Diócesis “ La Gran Misión del 2000” con el propósito de llegar a las familias.
En 2001, el 8 de septiembre, el sexto Obispo de la Diócesis , Monseñor Héctor Julio López Hurtado, toma posesión. Está renovando la tradición de visitar la Diócesis Parroquia por parroquia, incluyendo en ésta algunas de sus Veredas principales. Ha propuesto a toda la Diócesis , presbíteros y fieles, el estudio de los dos grandes proyectos pastorales que hay en Colombia: PDRE y SINE, con el fin de elegir uno, tras un serio discernimiento, que compromete a toda la Diócesis.
Celebraciones religiosas a destacar en el territorio de La Diócesis son entre otras: Nuestra Señora de La Salud (Nilo, 8 de septiembre); Nuestro Señor de la Salud (Pandi, 6 de agosto); El Corpus Christi (Anolaima); Santa Lucía (Tibacuy, 13 de diciembre). La fiesta patronal de la Diócesis se celebra el 29 de septiembre (día de San Miguel Arcángel).